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시뮬레이션

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타겟

PubMed/OpenAlex → PDF 파싱 → Embedding → PICO+ 추출 → RAG 질의응답 → 분자 시뮬레이션

🧬 시뮬레이션 결과

#	타겟	리간드	유형	엔진	점수	신뢰도
1	EGFR	cetuximab	항체 인터페이스	Biopython	25 contacts, ~200 Å²	EXPERIMENTAL
2	EGFR	erlotinib	소분자 도킹	Boltz-2	confidence 0.788, iptm 0.981	HIGH
3	PD-1	pembrolizumab	항체 인터페이스	Biopython	52 contacts, ~340 Å²	EXPERIMENTAL
4	PD-1	nivolumab	항체 인터페이스	Biopython	32 contacts, ~220 Å²	EXPERIMENTAL
5	EGFR	erlotinib	소분자 도킹	Vina	-7.605 kcal/mol	MEDIUM
6	HPV E6	p53	복합체 예측	Boltz-2	confidence 0.366	EXPLORATORY
7	HPV E7	Rb	복합체 예측	Boltz-2	confidence 0.395	EXPLORATORY
8	PI3Kα	alpelisib	소분자 도킹	Boltz-2	confidence 0.311	EXPLORATORY
9	mTOR	everolimus	소분자 도킹	—	—	대기 중
10	PD-L1	atezolizumab	항체 복합체	Boltz-2	복합체 예측 완료	MEDIUM
11	EGFR	nimotuzumab	항체 복합체	Boltz-2	복합체 예측 완료	MEDIUM
12	KRT6A	—	구조 예측	Boltz-2	항PD-1 내성 바이오마커	MEDIUM
13	PD-L1	—	구조 예측	Boltz-2	구조 예측 완료	MEDIUM
14	WBP5	pazopanib	소분자 도킹	Boltz-2	confidence 0.499, iptm 0.478	EXPLORATORY

📚 논문 커버리지

분야	논문 수	주요 키워드
안과	~900	trifocal IOL, glaucoma, cataract, MIGS, OCT
두경부 (HNSCC)	~1,500	cetuximab, pembrolizumab, HPV, EGFR, PD-L1
펩타이드/장수	~2,200	BPC-157, SS-31, MOTS-c, semaglutide, NAD+
PubMed MeSH Baseline	~15,000+	MeSH 필터링 (60개 MeSH term)

🧬 시뮬레이션 엔진

엔진	용도	실행	비용
Boltz-2	AI 구조 예측 + 결합	Modal GPU (클라우드)	~$0.02/건
AutoDock Vina	전통 physics-based 도킹	로컬 (Ryan-home)	무료
Biopython	인터페이스 분석	로컬	무료